Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT50

Cdc42bpb, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpbQ7TT50 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Cdc42bpbQ7TT50 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cdc42bpbQ7TT50 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cdc42bpbQ7TT50 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Cdc42bpbQ7TT50 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cdc42bpbQ7TT50 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cdc42bpbQ7TT50 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Cdc42bpbQ7TT50 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cdc42bpbQ7TT50 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Cdc42bpbQ7TT50 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Cdc42bpbQ7TT50 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cdc42bpbQ7TT50 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cdc42bpbQ7TT50 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cdc42bpbQ7TT50 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cdc42bpbQ7TT50 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cdc42bpbQ7TT50 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Cdc42bpbQ7TT50 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cdc42bpbQ7TT50 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cdc42bpbQ7TT50 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cdc42bpbQ7TT50 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Cdc42bpbQ7TT50 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cdc42bpbQ7TT50 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cdc42bpbQ7TT50 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cdc42bpbQ7TT50 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cdc42bpbQ7TT50 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cdc42bpbQ7TT50 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cdc42bpbQ7TT50 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cdc42bpbQ7TT50 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Cdc42bpbQ7TT50 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cdc42bpbQ7TT50 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cdc42bpbQ7TT50 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cdc42bpbQ7TT50 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cdc42bpbQ7TT50 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cdc42bpbQ7TT50 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cdc42bpbQ7TT50 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Cdc42bpbQ7TT50 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cdc42bpbQ7TT50 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cdc42bpbQ7TT50 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cdc42bpbQ7TT50 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cdc42bpbQ7TT50 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cdc42bpbQ7TT50 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cdc42bpbQ7TT50 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cdc42bpbQ7TT50 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cdc42bpbQ7TT50 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cdc42bpbQ7TT50 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cdc42bpbQ7TT50 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cdc42bpbQ7TT50 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cdc42bpbQ7TT50 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cdc42bpbQ7TT50 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cdc42bpbQ7TT50 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cdc42bpbQ7TT50 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cdc42bpbQ7TT50 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cdc42bpbQ7TT50 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdc42bpbQ7TT50 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdc42bpbQ7TT50 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdc42bpbQ7TT50 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdc42bpbQ7TT50 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdc42bpbQ7TT50 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdc42bpbQ7TT50 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdc42bpbQ7TT50 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdc42bpbQ7TT50 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdc42bpbQ7TT50 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdc42bpbQ7TT50 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdc42bpbQ7TT50 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdc42bpbQ7TT50 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdc42bpbQ7TT50 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdc42bpbQ7TT50 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdc42bpbQ7TT50 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdc42bpbQ7TT50 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdc42bpbQ7TT50 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdc42bpbQ7TT50 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdc42bpbQ7TT50 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdc42bpbQ7TT50 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdc42bpbQ7TT50 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdc42bpbQ7TT50 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdc42bpbQ7TT50 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdc42bpbQ7TT50 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdc42bpbQ7TT50 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cdc42bpbQ7TT50 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cdc42bpbQ7TT50 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cdc42bpbQ7TT50 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cdc42bpbQ7TT50 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cdc42bpbQ7TT50 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Cdc42bpbQ7TT50 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Cdc42bpbQ7TT50 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdc42bpbQ7TT50 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdc42bpbQ7TT50 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdc42bpbQ7TT50 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdc42bpbQ7TT50 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdc42bpbQ7TT50 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdc42bpbQ7TT50 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdc42bpbQ7TT50 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdc42bpbQ7TT50 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdc42bpbQ7TT50 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdc42bpbQ7TT50 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdc42bpbQ7TT50 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdc42bpbQ7TT50 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdc42bpbQ7TT50 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdc42bpbQ7TT50 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdc42bpbQ7TT50 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms