Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSI3

Ppp6r1, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp6r1Q7TSI3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppp6r1Q7TSI3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppp6r1Q7TSI3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppp6r1Q7TSI3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppp6r1Q7TSI3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppp6r1Q7TSI3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppp6r1Q7TSI3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppp6r1Q7TSI3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppp6r1Q7TSI3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppp6r1Q7TSI3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppp6r1Q7TSI3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppp6r1Q7TSI3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppp6r1Q7TSI3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppp6r1Q7TSI3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppp6r1Q7TSI3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppp6r1Q7TSI3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppp6r1Q7TSI3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppp6r1Q7TSI3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppp6r1Q7TSI3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppp6r1Q7TSI3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppp6r1Q7TSI3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppp6r1Q7TSI3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppp6r1Q7TSI3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppp6r1Q7TSI3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppp6r1Q7TSI3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppp6r1Q7TSI3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppp6r1Q7TSI3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppp6r1Q7TSI3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppp6r1Q7TSI3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppp6r1Q7TSI3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppp6r1Q7TSI3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppp6r1Q7TSI3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppp6r1Q7TSI3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppp6r1Q7TSI3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppp6r1Q7TSI3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppp6r1Q7TSI3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppp6r1Q7TSI3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppp6r1Q7TSI3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppp6r1Q7TSI3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppp6r1Q7TSI3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppp6r1Q7TSI3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppp6r1Q7TSI3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppp6r1Q7TSI3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppp6r1Q7TSI3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppp6r1Q7TSI3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppp6r1Q7TSI3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppp6r1Q7TSI3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppp6r1Q7TSI3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppp6r1Q7TSI3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppp6r1Q7TSI3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppp6r1Q7TSI3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppp6r1Q7TSI3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppp6r1Q7TSI3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppp6r1Q7TSI3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppp6r1Q7TSI3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppp6r1Q7TSI3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppp6r1Q7TSI3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppp6r1Q7TSI3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppp6r1Q7TSI3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppp6r1Q7TSI3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppp6r1Q7TSI3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppp6r1Q7TSI3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppp6r1Q7TSI3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppp6r1Q7TSI3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppp6r1Q7TSI3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppp6r1Q7TSI3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ppp6r1Q7TSI3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppp6r1Q7TSI3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppp6r1Q7TSI3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppp6r1Q7TSI3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppp6r1Q7TSI3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppp6r1Q7TSI3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppp6r1Q7TSI3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppp6r1Q7TSI3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppp6r1Q7TSI3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppp6r1Q7TSI3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppp6r1Q7TSI3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppp6r1Q7TSI3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppp6r1Q7TSI3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppp6r1Q7TSI3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppp6r1Q7TSI3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppp6r1Q7TSI3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppp6r1Q7TSI3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppp6r1Q7TSI3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppp6r1Q7TSI3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppp6r1Q7TSI3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppp6r1Q7TSI3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppp6r1Q7TSI3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppp6r1Q7TSI3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppp6r1Q7TSI3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppp6r1Q7TSI3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppp6r1Q7TSI3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppp6r1Q7TSI3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppp6r1Q7TSI3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppp6r1Q7TSI3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppp6r1Q7TSI3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppp6r1Q7TSI3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppp6r1Q7TSI3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppp6r1Q7TSI3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppp6r1Q7TSI3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms