Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctdp1Q7TSG2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ctdp1Q7TSG2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ctdp1Q7TSG2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ctdp1Q7TSG2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ctdp1Q7TSG2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ctdp1Q7TSG2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ctdp1Q7TSG2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ctdp1Q7TSG2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ctdp1Q7TSG2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ctdp1Q7TSG2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ctdp1Q7TSG2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms