Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNS8

Epop, Elongin BC and Polycomb repressive complex 2-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EpopQ7TNS8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EpopQ7TNS8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EpopQ7TNS8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EpopQ7TNS8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EpopQ7TNS8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EpopQ7TNS8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EpopQ7TNS8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EpopQ7TNS8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EpopQ7TNS8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EpopQ7TNS8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EpopQ7TNS8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EpopQ7TNS8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EpopQ7TNS8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EpopQ7TNS8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EpopQ7TNS8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EpopQ7TNS8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EpopQ7TNS8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EpopQ7TNS8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EpopQ7TNS8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EpopQ7TNS8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EpopQ7TNS8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EpopQ7TNS8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EpopQ7TNS8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EpopQ7TNS8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EpopQ7TNS8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EpopQ7TNS8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EpopQ7TNS8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EpopQ7TNS8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EpopQ7TNS8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EpopQ7TNS8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EpopQ7TNS8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EpopQ7TNS8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EpopQ7TNS8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EpopQ7TNS8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EpopQ7TNS8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EpopQ7TNS8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EpopQ7TNS8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EpopQ7TNS8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EpopQ7TNS8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EpopQ7TNS8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EpopQ7TNS8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EpopQ7TNS8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EpopQ7TNS8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EpopQ7TNS8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EpopQ7TNS8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EpopQ7TNS8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EpopQ7TNS8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EpopQ7TNS8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EpopQ7TNS8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EpopQ7TNS8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EpopQ7TNS8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms