Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sbno2Q7TNB8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms