Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HhipQ7TN16 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HhipQ7TN16 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HhipQ7TN16 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HhipQ7TN16 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HhipQ7TN16 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HhipQ7TN16 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HhipQ7TN16 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HhipQ7TN16 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HhipQ7TN16 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HhipQ7TN16 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HhipQ7TN16 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HhipQ7TN16 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HhipQ7TN16 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HhipQ7TN16 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HhipQ7TN16 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HhipQ7TN16 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HhipQ7TN16 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HhipQ7TN16 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HhipQ7TN16 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HhipQ7TN16 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HhipQ7TN16 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HhipQ7TN16 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HhipQ7TN16 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HhipQ7TN16 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HhipQ7TN16 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HhipQ7TN16 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HhipQ7TN16 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HhipQ7TN16 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HhipQ7TN16 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HhipQ7TN16 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HhipQ7TN16 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HhipQ7TN16 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HhipQ7TN16 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HhipQ7TN16 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HhipQ7TN16 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HhipQ7TN16 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HhipQ7TN16 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HhipQ7TN16 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HhipQ7TN16 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HhipQ7TN16 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HhipQ7TN16 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HhipQ7TN16 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HhipQ7TN16 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HhipQ7TN16 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HhipQ7TN16 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HhipQ7TN16 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HhipQ7TN16 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HhipQ7TN16 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HhipQ7TN16 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HhipQ7TN16 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HhipQ7TN16 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HhipQ7TN16 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HhipQ7TN16 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HhipQ7TN16 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HhipQ7TN16 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HhipQ7TN16 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HhipQ7TN16 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HhipQ7TN16 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HhipQ7TN16 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HhipQ7TN16 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HhipQ7TN16 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HhipQ7TN16 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HhipQ7TN16 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HhipQ7TN16 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HhipQ7TN16 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HhipQ7TN16 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HhipQ7TN16 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HhipQ7TN16 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HhipQ7TN16 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HhipQ7TN16 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HhipQ7TN16 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HhipQ7TN16 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HhipQ7TN16 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HhipQ7TN16 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HhipQ7TN16 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HhipQ7TN16 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HhipQ7TN16 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HhipQ7TN16 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HhipQ7TN16 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HhipQ7TN16 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HhipQ7TN16 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HhipQ7TN16 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HhipQ7TN16 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HhipQ7TN16 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HhipQ7TN16 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HhipQ7TN16 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HhipQ7TN16 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HhipQ7TN16 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HhipQ7TN16 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HhipQ7TN16 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HhipQ7TN16 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HhipQ7TN16 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HhipQ7TN16 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HhipQ7TN16 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HhipQ7TN16 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HhipQ7TN16 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HhipQ7TN16 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HhipQ7TN16 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HhipQ7TN16 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms