Protein–RNA interactions for Protein: Q70E20

Sned1, Sushi, nidogen and EGF-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sned1Q70E20 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sned1Q70E20 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sned1Q70E20 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sned1Q70E20 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sned1Q70E20 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sned1Q70E20 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sned1Q70E20 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sned1Q70E20 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sned1Q70E20 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sned1Q70E20 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sned1Q70E20 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sned1Q70E20 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sned1Q70E20 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sned1Q70E20 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sned1Q70E20 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sned1Q70E20 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sned1Q70E20 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sned1Q70E20 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Sned1Q70E20 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sned1Q70E20 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sned1Q70E20 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sned1Q70E20 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sned1Q70E20 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sned1Q70E20 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sned1Q70E20 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sned1Q70E20 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sned1Q70E20 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sned1Q70E20 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sned1Q70E20 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sned1Q70E20 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Sned1Q70E20 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sned1Q70E20 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sned1Q70E20 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sned1Q70E20 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sned1Q70E20 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sned1Q70E20 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sned1Q70E20 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sned1Q70E20 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sned1Q70E20 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Sned1Q70E20 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sned1Q70E20 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sned1Q70E20 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sned1Q70E20 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sned1Q70E20 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sned1Q70E20 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sned1Q70E20 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sned1Q70E20 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sned1Q70E20 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sned1Q70E20 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sned1Q70E20 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sned1Q70E20 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sned1Q70E20 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sned1Q70E20 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sned1Q70E20 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sned1Q70E20 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sned1Q70E20 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sned1Q70E20 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sned1Q70E20 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sned1Q70E20 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sned1Q70E20 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Sned1Q70E20 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sned1Q70E20 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Sned1Q70E20 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sned1Q70E20 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sned1Q70E20 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sned1Q70E20 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sned1Q70E20 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sned1Q70E20 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sned1Q70E20 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sned1Q70E20 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sned1Q70E20 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sned1Q70E20 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sned1Q70E20 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sned1Q70E20 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sned1Q70E20 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sned1Q70E20 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sned1Q70E20 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sned1Q70E20 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sned1Q70E20 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sned1Q70E20 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sned1Q70E20 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sned1Q70E20 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sned1Q70E20 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sned1Q70E20 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sned1Q70E20 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sned1Q70E20 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sned1Q70E20 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sned1Q70E20 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sned1Q70E20 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sned1Q70E20 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sned1Q70E20 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sned1Q70E20 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sned1Q70E20 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sned1Q70E20 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sned1Q70E20 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sned1Q70E20 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sned1Q70E20 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sned1Q70E20 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sned1Q70E20 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sned1Q70E20 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms