Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQH8

Nup188, Nucleoporin NUP188 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup188Q6ZQH8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup188Q6ZQH8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup188Q6ZQH8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup188Q6ZQH8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup188Q6ZQH8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup188Q6ZQH8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup188Q6ZQH8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup188Q6ZQH8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup188Q6ZQH8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup188Q6ZQH8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup188Q6ZQH8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup188Q6ZQH8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup188Q6ZQH8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup188Q6ZQH8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup188Q6ZQH8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup188Q6ZQH8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup188Q6ZQH8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup188Q6ZQH8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup188Q6ZQH8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup188Q6ZQH8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup188Q6ZQH8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup188Q6ZQH8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup188Q6ZQH8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup188Q6ZQH8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup188Q6ZQH8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup188Q6ZQH8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup188Q6ZQH8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup188Q6ZQH8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup188Q6ZQH8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup188Q6ZQH8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup188Q6ZQH8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup188Q6ZQH8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup188Q6ZQH8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup188Q6ZQH8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup188Q6ZQH8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup188Q6ZQH8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup188Q6ZQH8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup188Q6ZQH8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup188Q6ZQH8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup188Q6ZQH8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup188Q6ZQH8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup188Q6ZQH8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup188Q6ZQH8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup188Q6ZQH8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup188Q6ZQH8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup188Q6ZQH8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup188Q6ZQH8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup188Q6ZQH8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup188Q6ZQH8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup188Q6ZQH8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup188Q6ZQH8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup188Q6ZQH8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup188Q6ZQH8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup188Q6ZQH8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup188Q6ZQH8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup188Q6ZQH8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup188Q6ZQH8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup188Q6ZQH8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup188Q6ZQH8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup188Q6ZQH8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup188Q6ZQH8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup188Q6ZQH8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup188Q6ZQH8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup188Q6ZQH8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nup188Q6ZQH8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nup188Q6ZQH8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nup188Q6ZQH8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup188Q6ZQH8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup188Q6ZQH8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup188Q6ZQH8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup188Q6ZQH8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup188Q6ZQH8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup188Q6ZQH8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup188Q6ZQH8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup188Q6ZQH8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup188Q6ZQH8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nup188Q6ZQH8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nup188Q6ZQH8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nup188Q6ZQH8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Nup188Q6ZQH8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Nup188Q6ZQH8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nup188Q6ZQH8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nup188Q6ZQH8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nup188Q6ZQH8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nup188Q6ZQH8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nup188Q6ZQH8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nup188Q6ZQH8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nup188Q6ZQH8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup188Q6ZQH8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup188Q6ZQH8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup188Q6ZQH8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup188Q6ZQH8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup188Q6ZQH8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup188Q6ZQH8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup188Q6ZQH8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup188Q6ZQH8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup188Q6ZQH8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup188Q6ZQH8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup188Q6ZQH8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup188Q6ZQH8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms