Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Topbp1Q6ZQF0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Topbp1Q6ZQF0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Topbp1Q6ZQF0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Topbp1Q6ZQF0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Topbp1Q6ZQF0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Topbp1Q6ZQF0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Topbp1Q6ZQF0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Topbp1Q6ZQF0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Topbp1Q6ZQF0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Topbp1Q6ZQF0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Topbp1Q6ZQF0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Topbp1Q6ZQF0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Topbp1Q6ZQF0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Topbp1Q6ZQF0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Topbp1Q6ZQF0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Topbp1Q6ZQF0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Topbp1Q6ZQF0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Topbp1Q6ZQF0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Topbp1Q6ZQF0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Topbp1Q6ZQF0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Topbp1Q6ZQF0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Topbp1Q6ZQF0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Topbp1Q6ZQF0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Topbp1Q6ZQF0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Topbp1Q6ZQF0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Topbp1Q6ZQF0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Topbp1Q6ZQF0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Topbp1Q6ZQF0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Topbp1Q6ZQF0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Topbp1Q6ZQF0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Topbp1Q6ZQF0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Topbp1Q6ZQF0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Topbp1Q6ZQF0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Topbp1Q6ZQF0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Topbp1Q6ZQF0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Topbp1Q6ZQF0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Topbp1Q6ZQF0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Topbp1Q6ZQF0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Topbp1Q6ZQF0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Topbp1Q6ZQF0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Topbp1Q6ZQF0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Topbp1Q6ZQF0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Topbp1Q6ZQF0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Topbp1Q6ZQF0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Topbp1Q6ZQF0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Topbp1Q6ZQF0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Topbp1Q6ZQF0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Topbp1Q6ZQF0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Topbp1Q6ZQF0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Topbp1Q6ZQF0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Topbp1Q6ZQF0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Topbp1Q6ZQF0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Topbp1Q6ZQF0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Topbp1Q6ZQF0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Topbp1Q6ZQF0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Topbp1Q6ZQF0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Topbp1Q6ZQF0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Topbp1Q6ZQF0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Topbp1Q6ZQF0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Topbp1Q6ZQF0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Topbp1Q6ZQF0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Topbp1Q6ZQF0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Topbp1Q6ZQF0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Topbp1Q6ZQF0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Topbp1Q6ZQF0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Topbp1Q6ZQF0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Topbp1Q6ZQF0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Topbp1Q6ZQF0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Topbp1Q6ZQF0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Topbp1Q6ZQF0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Topbp1Q6ZQF0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Topbp1Q6ZQF0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Topbp1Q6ZQF0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Topbp1Q6ZQF0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Topbp1Q6ZQF0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Topbp1Q6ZQF0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Topbp1Q6ZQF0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Topbp1Q6ZQF0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Topbp1Q6ZQF0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Topbp1Q6ZQF0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Topbp1Q6ZQF0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Topbp1Q6ZQF0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Topbp1Q6ZQF0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Topbp1Q6ZQF0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Topbp1Q6ZQF0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Topbp1Q6ZQF0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Topbp1Q6ZQF0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Topbp1Q6ZQF0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Topbp1Q6ZQF0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Topbp1Q6ZQF0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Topbp1Q6ZQF0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Topbp1Q6ZQF0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Topbp1Q6ZQF0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Topbp1Q6ZQF0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Topbp1Q6ZQF0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
Topbp1Q6ZQF0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Topbp1Q6ZQF0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Topbp1Q6ZQF0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms