Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ift172Q6VH22 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ift172Q6VH22 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ift172Q6VH22 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ift172Q6VH22 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ift172Q6VH22 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ift172Q6VH22 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ift172Q6VH22 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ift172Q6VH22 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ift172Q6VH22 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ift172Q6VH22 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ift172Q6VH22 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ift172Q6VH22 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ift172Q6VH22 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ift172Q6VH22 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ift172Q6VH22 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ift172Q6VH22 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ift172Q6VH22 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ift172Q6VH22 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ift172Q6VH22 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ift172Q6VH22 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ift172Q6VH22 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ift172Q6VH22 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ift172Q6VH22 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ift172Q6VH22 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ift172Q6VH22 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ift172Q6VH22 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ift172Q6VH22 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ift172Q6VH22 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ift172Q6VH22 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ift172Q6VH22 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ift172Q6VH22 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ift172Q6VH22 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ift172Q6VH22 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ift172Q6VH22 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ift172Q6VH22 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ift172Q6VH22 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ift172Q6VH22 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ift172Q6VH22 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ift172Q6VH22 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ift172Q6VH22 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ift172Q6VH22 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ift172Q6VH22 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ift172Q6VH22 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ift172Q6VH22 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ift172Q6VH22 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ift172Q6VH22 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ift172Q6VH22 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ift172Q6VH22 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ift172Q6VH22 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ift172Q6VH22 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ift172Q6VH22 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ift172Q6VH22 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ift172Q6VH22 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ift172Q6VH22 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ift172Q6VH22 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ift172Q6VH22 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ift172Q6VH22 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ift172Q6VH22 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ift172Q6VH22 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ift172Q6VH22 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ift172Q6VH22 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ift172Q6VH22 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ift172Q6VH22 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ift172Q6VH22 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ift172Q6VH22 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ift172Q6VH22 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ift172Q6VH22 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ift172Q6VH22 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ift172Q6VH22 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ift172Q6VH22 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ift172Q6VH22 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ift172Q6VH22 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ift172Q6VH22 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ift172Q6VH22 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ift172Q6VH22 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ift172Q6VH22 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ift172Q6VH22 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ift172Q6VH22 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ift172Q6VH22 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ift172Q6VH22 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ift172Q6VH22 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ift172Q6VH22 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ift172Q6VH22 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ift172Q6VH22 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ift172Q6VH22 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ift172Q6VH22 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ift172Q6VH22 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ift172Q6VH22 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ift172Q6VH22 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ift172Q6VH22 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Ift172Q6VH22 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ift172Q6VH22 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ift172Q6VH22 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ift172Q6VH22 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ift172Q6VH22 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ift172Q6VH22 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ift172Q6VH22 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ift172Q6VH22 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ift172Q6VH22 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms