Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q477

Atp2b4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b4Q6Q477 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Atp2b4Q6Q477 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp2b4Q6Q477 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms