Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nudcd1Q6PIP5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms