Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gapvd1Q6PAR5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gapvd1Q6PAR5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gapvd1Q6PAR5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gapvd1Q6PAR5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gapvd1Q6PAR5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gapvd1Q6PAR5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gapvd1Q6PAR5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gapvd1Q6PAR5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Gapvd1Q6PAR5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gapvd1Q6PAR5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gapvd1Q6PAR5 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gapvd1Q6PAR5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gapvd1Q6PAR5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gapvd1Q6PAR5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gapvd1Q6PAR5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gapvd1Q6PAR5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gapvd1Q6PAR5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gapvd1Q6PAR5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gapvd1Q6PAR5 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Gapvd1Q6PAR5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gapvd1Q6PAR5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Gapvd1Q6PAR5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Gapvd1Q6PAR5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Gapvd1Q6PAR5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Gapvd1Q6PAR5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Gapvd1Q6PAR5 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Gapvd1Q6PAR5 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Gapvd1Q6PAR5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Gapvd1Q6PAR5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gapvd1Q6PAR5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gapvd1Q6PAR5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gapvd1Q6PAR5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gapvd1Q6PAR5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gapvd1Q6PAR5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Gapvd1Q6PAR5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Gapvd1Q6PAR5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gapvd1Q6PAR5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gapvd1Q6PAR5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gapvd1Q6PAR5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gapvd1Q6PAR5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gapvd1Q6PAR5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gapvd1Q6PAR5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gapvd1Q6PAR5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gapvd1Q6PAR5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gapvd1Q6PAR5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gapvd1Q6PAR5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gapvd1Q6PAR5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Gapvd1Q6PAR5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gapvd1Q6PAR5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gapvd1Q6PAR5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gapvd1Q6PAR5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gapvd1Q6PAR5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gapvd1Q6PAR5 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gapvd1Q6PAR5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gapvd1Q6PAR5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gapvd1Q6PAR5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gapvd1Q6PAR5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gapvd1Q6PAR5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gapvd1Q6PAR5 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gapvd1Q6PAR5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gapvd1Q6PAR5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gapvd1Q6PAR5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gapvd1Q6PAR5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gapvd1Q6PAR5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gapvd1Q6PAR5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gapvd1Q6PAR5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Gapvd1Q6PAR5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Gapvd1Q6PAR5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gapvd1Q6PAR5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gapvd1Q6PAR5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gapvd1Q6PAR5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gapvd1Q6PAR5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gapvd1Q6PAR5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gapvd1Q6PAR5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gapvd1Q6PAR5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gapvd1Q6PAR5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gapvd1Q6PAR5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gapvd1Q6PAR5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Gapvd1Q6PAR5 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gapvd1Q6PAR5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gapvd1Q6PAR5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gapvd1Q6PAR5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Gapvd1Q6PAR5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gapvd1Q6PAR5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gapvd1Q6PAR5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gapvd1Q6PAR5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gapvd1Q6PAR5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Gapvd1Q6PAR5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gapvd1Q6PAR5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gapvd1Q6PAR5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gapvd1Q6PAR5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gapvd1Q6PAR5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gapvd1Q6PAR5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gapvd1Q6PAR5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gapvd1Q6PAR5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gapvd1Q6PAR5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gapvd1Q6PAR5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gapvd1Q6PAR5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gapvd1Q6PAR5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms