Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HelbQ6NVF4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HelbQ6NVF4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HelbQ6NVF4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HelbQ6NVF4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HelbQ6NVF4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HelbQ6NVF4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HelbQ6NVF4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HelbQ6NVF4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HelbQ6NVF4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HelbQ6NVF4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HelbQ6NVF4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HelbQ6NVF4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HelbQ6NVF4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HelbQ6NVF4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HelbQ6NVF4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HelbQ6NVF4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HelbQ6NVF4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HelbQ6NVF4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HelbQ6NVF4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HelbQ6NVF4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HelbQ6NVF4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HelbQ6NVF4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HelbQ6NVF4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HelbQ6NVF4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HelbQ6NVF4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HelbQ6NVF4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HelbQ6NVF4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HelbQ6NVF4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HelbQ6NVF4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HelbQ6NVF4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HelbQ6NVF4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HelbQ6NVF4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HelbQ6NVF4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HelbQ6NVF4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HelbQ6NVF4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HelbQ6NVF4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HelbQ6NVF4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HelbQ6NVF4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HelbQ6NVF4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HelbQ6NVF4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HelbQ6NVF4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HelbQ6NVF4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HelbQ6NVF4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HelbQ6NVF4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HelbQ6NVF4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HelbQ6NVF4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HelbQ6NVF4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HelbQ6NVF4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HelbQ6NVF4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HelbQ6NVF4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HelbQ6NVF4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HelbQ6NVF4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HelbQ6NVF4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HelbQ6NVF4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HelbQ6NVF4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HelbQ6NVF4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HelbQ6NVF4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HelbQ6NVF4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HelbQ6NVF4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HelbQ6NVF4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HelbQ6NVF4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HelbQ6NVF4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HelbQ6NVF4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HelbQ6NVF4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HelbQ6NVF4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HelbQ6NVF4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HelbQ6NVF4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HelbQ6NVF4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HelbQ6NVF4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HelbQ6NVF4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HelbQ6NVF4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms