Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pdcd11Q6NS46 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pdcd11Q6NS46 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pdcd11Q6NS46 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Pdcd11Q6NS46 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Pdcd11Q6NS46 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pdcd11Q6NS46 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pdcd11Q6NS46 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pdcd11Q6NS46 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pdcd11Q6NS46 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pdcd11Q6NS46 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pdcd11Q6NS46 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pdcd11Q6NS46 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pdcd11Q6NS46 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pdcd11Q6NS46 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pdcd11Q6NS46 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pdcd11Q6NS46 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pdcd11Q6NS46 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Pdcd11Q6NS46 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pdcd11Q6NS46 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Pdcd11Q6NS46 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pdcd11Q6NS46 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Pdcd11Q6NS46 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Pdcd11Q6NS46 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pdcd11Q6NS46 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pdcd11Q6NS46 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Pdcd11Q6NS46 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pdcd11Q6NS46 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pdcd11Q6NS46 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Pdcd11Q6NS46 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pdcd11Q6NS46 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pdcd11Q6NS46 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pdcd11Q6NS46 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pdcd11Q6NS46 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pdcd11Q6NS46 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pdcd11Q6NS46 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pdcd11Q6NS46 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Pdcd11Q6NS46 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pdcd11Q6NS46 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pdcd11Q6NS46 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pdcd11Q6NS46 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pdcd11Q6NS46 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pdcd11Q6NS46 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pdcd11Q6NS46 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Pdcd11Q6NS46 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pdcd11Q6NS46 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pdcd11Q6NS46 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pdcd11Q6NS46 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Pdcd11Q6NS46 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Pdcd11Q6NS46 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pdcd11Q6NS46 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pdcd11Q6NS46 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pdcd11Q6NS46 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pdcd11Q6NS46 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Pdcd11Q6NS46 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pdcd11Q6NS46 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pdcd11Q6NS46 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pdcd11Q6NS46 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Pdcd11Q6NS46 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Pdcd11Q6NS46 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Pdcd11Q6NS46 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pdcd11Q6NS46 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pdcd11Q6NS46 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pdcd11Q6NS46 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pdcd11Q6NS46 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pdcd11Q6NS46 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pdcd11Q6NS46 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pdcd11Q6NS46 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pdcd11Q6NS46 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pdcd11Q6NS46 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pdcd11Q6NS46 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pdcd11Q6NS46 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pdcd11Q6NS46 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pdcd11Q6NS46 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pdcd11Q6NS46 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pdcd11Q6NS46 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pdcd11Q6NS46 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pdcd11Q6NS46 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pdcd11Q6NS46 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pdcd11Q6NS46 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pdcd11Q6NS46 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pdcd11Q6NS46 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pdcd11Q6NS46 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pdcd11Q6NS46 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pdcd11Q6NS46 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pdcd11Q6NS46 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pdcd11Q6NS46 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pdcd11Q6NS46 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Pdcd11Q6NS46 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pdcd11Q6NS46 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pdcd11Q6NS46 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pdcd11Q6NS46 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pdcd11Q6NS46 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Pdcd11Q6NS46 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pdcd11Q6NS46 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pdcd11Q6NS46 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pdcd11Q6NS46 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pdcd11Q6NS46 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Pdcd11Q6NS46 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Pdcd11Q6NS46 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms