Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc66Q6NS45 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc66Q6NS45 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc66Q6NS45 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc66Q6NS45 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc66Q6NS45 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc66Q6NS45 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc66Q6NS45 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc66Q6NS45 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc66Q6NS45 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc66Q6NS45 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc66Q6NS45 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc66Q6NS45 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc66Q6NS45 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc66Q6NS45 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc66Q6NS45 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc66Q6NS45 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc66Q6NS45 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc66Q6NS45 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc66Q6NS45 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc66Q6NS45 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc66Q6NS45 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc66Q6NS45 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc66Q6NS45 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc66Q6NS45 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc66Q6NS45 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc66Q6NS45 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc66Q6NS45 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc66Q6NS45 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc66Q6NS45 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc66Q6NS45 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc66Q6NS45 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc66Q6NS45 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc66Q6NS45 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc66Q6NS45 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc66Q6NS45 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc66Q6NS45 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc66Q6NS45 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms