Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ParpbpQ6IRT3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms