Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQX2

Nckap5l, Nck-associated protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap5lQ6GQX2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nckap5lQ6GQX2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nckap5lQ6GQX2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nckap5lQ6GQX2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nckap5lQ6GQX2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Nckap5lQ6GQX2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nckap5lQ6GQX2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nckap5lQ6GQX2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nckap5lQ6GQX2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nckap5lQ6GQX2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nckap5lQ6GQX2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nckap5lQ6GQX2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nckap5lQ6GQX2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nckap5lQ6GQX2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Nckap5lQ6GQX2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Nckap5lQ6GQX2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nckap5lQ6GQX2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nckap5lQ6GQX2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Nckap5lQ6GQX2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nckap5lQ6GQX2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nckap5lQ6GQX2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nckap5lQ6GQX2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nckap5lQ6GQX2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nckap5lQ6GQX2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nckap5lQ6GQX2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nckap5lQ6GQX2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nckap5lQ6GQX2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nckap5lQ6GQX2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nckap5lQ6GQX2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nckap5lQ6GQX2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nckap5lQ6GQX2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nckap5lQ6GQX2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nckap5lQ6GQX2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nckap5lQ6GQX2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nckap5lQ6GQX2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nckap5lQ6GQX2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nckap5lQ6GQX2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nckap5lQ6GQX2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nckap5lQ6GQX2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nckap5lQ6GQX2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nckap5lQ6GQX2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nckap5lQ6GQX2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nckap5lQ6GQX2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nckap5lQ6GQX2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nckap5lQ6GQX2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nckap5lQ6GQX2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nckap5lQ6GQX2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nckap5lQ6GQX2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nckap5lQ6GQX2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nckap5lQ6GQX2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Nckap5lQ6GQX2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Nckap5lQ6GQX2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nckap5lQ6GQX2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nckap5lQ6GQX2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nckap5lQ6GQX2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nckap5lQ6GQX2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nckap5lQ6GQX2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Nckap5lQ6GQX2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nckap5lQ6GQX2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Nckap5lQ6GQX2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nckap5lQ6GQX2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nckap5lQ6GQX2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nckap5lQ6GQX2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nckap5lQ6GQX2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nckap5lQ6GQX2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nckap5lQ6GQX2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nckap5lQ6GQX2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nckap5lQ6GQX2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nckap5lQ6GQX2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nckap5lQ6GQX2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nckap5lQ6GQX2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nckap5lQ6GQX2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Nckap5lQ6GQX2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nckap5lQ6GQX2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nckap5lQ6GQX2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nckap5lQ6GQX2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nckap5lQ6GQX2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nckap5lQ6GQX2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nckap5lQ6GQX2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nckap5lQ6GQX2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nckap5lQ6GQX2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nckap5lQ6GQX2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nckap5lQ6GQX2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nckap5lQ6GQX2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nckap5lQ6GQX2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nckap5lQ6GQX2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nckap5lQ6GQX2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nckap5lQ6GQX2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nckap5lQ6GQX2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nckap5lQ6GQX2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nckap5lQ6GQX2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nckap5lQ6GQX2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nckap5lQ6GQX2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nckap5lQ6GQX2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nckap5lQ6GQX2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Nckap5lQ6GQX2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nckap5lQ6GQX2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nckap5lQ6GQX2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nckap5lQ6GQX2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nckap5lQ6GQX2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms