Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scaf8Q6DID3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scaf8Q6DID3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scaf8Q6DID3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scaf8Q6DID3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scaf8Q6DID3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scaf8Q6DID3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scaf8Q6DID3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scaf8Q6DID3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scaf8Q6DID3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scaf8Q6DID3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scaf8Q6DID3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scaf8Q6DID3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scaf8Q6DID3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scaf8Q6DID3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scaf8Q6DID3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scaf8Q6DID3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scaf8Q6DID3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scaf8Q6DID3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scaf8Q6DID3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scaf8Q6DID3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scaf8Q6DID3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scaf8Q6DID3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scaf8Q6DID3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scaf8Q6DID3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scaf8Q6DID3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Scaf8Q6DID3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Scaf8Q6DID3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scaf8Q6DID3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scaf8Q6DID3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Scaf8Q6DID3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scaf8Q6DID3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scaf8Q6DID3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scaf8Q6DID3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scaf8Q6DID3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scaf8Q6DID3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scaf8Q6DID3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scaf8Q6DID3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scaf8Q6DID3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scaf8Q6DID3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scaf8Q6DID3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scaf8Q6DID3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scaf8Q6DID3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scaf8Q6DID3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scaf8Q6DID3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Scaf8Q6DID3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scaf8Q6DID3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scaf8Q6DID3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms