Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdk13Q69ZA1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdk13Q69ZA1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdk13Q69ZA1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdk13Q69ZA1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdk13Q69ZA1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdk13Q69ZA1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdk13Q69ZA1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdk13Q69ZA1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdk13Q69ZA1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdk13Q69ZA1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdk13Q69ZA1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdk13Q69ZA1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdk13Q69ZA1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdk13Q69ZA1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdk13Q69ZA1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdk13Q69ZA1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdk13Q69ZA1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdk13Q69ZA1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdk13Q69ZA1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdk13Q69ZA1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdk13Q69ZA1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdk13Q69ZA1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdk13Q69ZA1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdk13Q69ZA1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdk13Q69ZA1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdk13Q69ZA1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdk13Q69ZA1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdk13Q69ZA1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdk13Q69ZA1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdk13Q69ZA1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdk13Q69ZA1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdk13Q69ZA1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdk13Q69ZA1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdk13Q69ZA1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdk13Q69ZA1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdk13Q69ZA1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdk13Q69ZA1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdk13Q69ZA1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdk13Q69ZA1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdk13Q69ZA1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdk13Q69ZA1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdk13Q69ZA1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdk13Q69ZA1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdk13Q69ZA1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdk13Q69ZA1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdk13Q69ZA1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdk13Q69ZA1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdk13Q69ZA1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdk13Q69ZA1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdk13Q69ZA1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdk13Q69ZA1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdk13Q69ZA1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdk13Q69ZA1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdk13Q69ZA1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Cdk13Q69ZA1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Cdk13Q69ZA1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cdk13Q69ZA1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cdk13Q69ZA1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cdk13Q69ZA1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Cdk13Q69ZA1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdk13Q69ZA1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdk13Q69ZA1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdk13Q69ZA1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdk13Q69ZA1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdk13Q69ZA1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdk13Q69ZA1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdk13Q69ZA1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdk13Q69ZA1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdk13Q69ZA1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdk13Q69ZA1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdk13Q69ZA1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdk13Q69ZA1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdk13Q69ZA1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdk13Q69ZA1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdk13Q69ZA1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdk13Q69ZA1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdk13Q69ZA1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdk13Q69ZA1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdk13Q69ZA1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdk13Q69ZA1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdk13Q69ZA1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdk13Q69ZA1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdk13Q69ZA1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdk13Q69ZA1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdk13Q69ZA1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdk13Q69ZA1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdk13Q69ZA1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdk13Q69ZA1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdk13Q69ZA1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdk13Q69ZA1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdk13Q69ZA1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdk13Q69ZA1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdk13Q69ZA1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdk13Q69ZA1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdk13Q69ZA1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdk13Q69ZA1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdk13Q69ZA1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdk13Q69ZA1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cdk13Q69ZA1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms