Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Hoxa13Q62424 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxa13Q62424 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxa13Q62424 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxa13Q62424 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxa13Q62424 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxa13Q62424 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxa13Q62424 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxa13Q62424 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxa13Q62424 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxa13Q62424 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxa13Q62424 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxa13Q62424 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxa13Q62424 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxa13Q62424 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxa13Q62424 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxa13Q62424 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxa13Q62424 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
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