Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sall3Q62255 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sall3Q62255 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Sall3Q62255 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sall3Q62255 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sall3Q62255 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sall3Q62255 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sall3Q62255 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sall3Q62255 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sall3Q62255 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sall3Q62255 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sall3Q62255 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sall3Q62255 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sall3Q62255 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sall3Q62255 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sall3Q62255 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Sall3Q62255 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Sall3Q62255 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sall3Q62255 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sall3Q62255 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sall3Q62255 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sall3Q62255 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sall3Q62255 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sall3Q62255 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sall3Q62255 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sall3Q62255 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sall3Q62255 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sall3Q62255 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Sall3Q62255 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Sall3Q62255 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Sall3Q62255 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Sall3Q62255 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sall3Q62255 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sall3Q62255 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sall3Q62255 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sall3Q62255 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sall3Q62255 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sall3Q62255 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sall3Q62255 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sall3Q62255 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sall3Q62255 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sall3Q62255 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sall3Q62255 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sall3Q62255 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sall3Q62255 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Sall3Q62255 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sall3Q62255 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sall3Q62255 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sall3Q62255 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sall3Q62255 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sall3Q62255 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sall3Q62255 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sall3Q62255 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Sall3Q62255 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sall3Q62255 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Sall3Q62255 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sall3Q62255 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sall3Q62255 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sall3Q62255 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sall3Q62255 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sall3Q62255 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sall3Q62255 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sall3Q62255 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sall3Q62255 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sall3Q62255 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sall3Q62255 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sall3Q62255 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sall3Q62255 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Sall3Q62255 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sall3Q62255 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sall3Q62255 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sall3Q62255 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sall3Q62255 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sall3Q62255 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sall3Q62255 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Sall3Q62255 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sall3Q62255 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sall3Q62255 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Sall3Q62255 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sall3Q62255 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sall3Q62255 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sall3Q62255 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Sall3Q62255 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sall3Q62255 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sall3Q62255 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Sall3Q62255 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Sall3Q62255 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sall3Q62255 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sall3Q62255 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sall3Q62255 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sall3Q62255 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sall3Q62255 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sall3Q62255 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sall3Q62255 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sall3Q62255 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sall3Q62255 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sall3Q62255 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sall3Q62255 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sall3Q62255 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sall3Q62255 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms