Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Odf1Q61999 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Odf1Q61999 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Odf1Q61999 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Odf1Q61999 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Odf1Q61999 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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