Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gli3Q61602 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Gli3Q61602 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gli3Q61602 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gli3Q61602 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gli3Q61602 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gli3Q61602 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gli3Q61602 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gli3Q61602 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gli3Q61602 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Gli3Q61602 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gli3Q61602 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gli3Q61602 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gli3Q61602 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gli3Q61602 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gli3Q61602 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gli3Q61602 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gli3Q61602 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Gli3Q61602 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gli3Q61602 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gli3Q61602 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gli3Q61602 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gli3Q61602 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gli3Q61602 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gli3Q61602 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gli3Q61602 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gli3Q61602 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gli3Q61602 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Gli3Q61602 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Gli3Q61602 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Gli3Q61602 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gli3Q61602 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gli3Q61602 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gli3Q61602 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gli3Q61602 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gli3Q61602 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gli3Q61602 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gli3Q61602 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gli3Q61602 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gli3Q61602 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gli3Q61602 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gli3Q61602 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gli3Q61602 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gli3Q61602 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gli3Q61602 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gli3Q61602 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gli3Q61602 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gli3Q61602 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gli3Q61602 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gli3Q61602 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gli3Q61602 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gli3Q61602 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gli3Q61602 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Gli3Q61602 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gli3Q61602 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gli3Q61602 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Gli3Q61602 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gli3Q61602 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gli3Q61602 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gli3Q61602 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Gli3Q61602 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gli3Q61602 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gli3Q61602 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gli3Q61602 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gli3Q61602 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gli3Q61602 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gli3Q61602 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gli3Q61602 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gli3Q61602 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gli3Q61602 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gli3Q61602 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gli3Q61602 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Gli3Q61602 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gli3Q61602 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gli3Q61602 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Gli3Q61602 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gli3Q61602 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gli3Q61602 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gli3Q61602 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gli3Q61602 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gli3Q61602 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gli3Q61602 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gli3Q61602 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gli3Q61602 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gli3Q61602 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gli3Q61602 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gli3Q61602 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Gli3Q61602 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Gli3Q61602 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gli3Q61602 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gli3Q61602 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gli3Q61602 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gli3Q61602 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gli3Q61602 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gli3Q61602 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gli3Q61602 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gli3Q61602 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gli3Q61602 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gli3Q61602 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gli3Q61602 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms