Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ecm1Q61508 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ecm1Q61508 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ecm1Q61508 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ecm1Q61508 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ecm1Q61508 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ecm1Q61508 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ecm1Q61508 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ecm1Q61508 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ecm1Q61508 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ecm1Q61508 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ecm1Q61508 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ecm1Q61508 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ecm1Q61508 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ecm1Q61508 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ecm1Q61508 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ecm1Q61508 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ecm1Q61508 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ecm1Q61508 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ecm1Q61508 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ecm1Q61508 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ecm1Q61508 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ecm1Q61508 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ecm1Q61508 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ecm1Q61508 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ecm1Q61508 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ecm1Q61508 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ecm1Q61508 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ecm1Q61508 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ecm1Q61508 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ecm1Q61508 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ecm1Q61508 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ecm1Q61508 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ecm1Q61508 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ecm1Q61508 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ecm1Q61508 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ecm1Q61508 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ecm1Q61508 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ecm1Q61508 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ecm1Q61508 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ecm1Q61508 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ecm1Q61508 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ecm1Q61508 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ecm1Q61508 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ecm1Q61508 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ecm1Q61508 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ecm1Q61508 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ecm1Q61508 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ecm1Q61508 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ecm1Q61508 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ecm1Q61508 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ecm1Q61508 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ecm1Q61508 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ecm1Q61508 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ecm1Q61508 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ecm1Q61508 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ecm1Q61508 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ecm1Q61508 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ecm1Q61508 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ecm1Q61508 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ecm1Q61508 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ecm1Q61508 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ecm1Q61508 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ecm1Q61508 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ecm1Q61508 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ecm1Q61508 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ecm1Q61508 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ecm1Q61508 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ecm1Q61508 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ecm1Q61508 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ecm1Q61508 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ecm1Q61508 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ecm1Q61508 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ecm1Q61508 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ecm1Q61508 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ecm1Q61508 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ecm1Q61508 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ecm1Q61508 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ecm1Q61508 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ecm1Q61508 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ecm1Q61508 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ecm1Q61508 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ecm1Q61508 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ecm1Q61508 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ecm1Q61508 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ecm1Q61508 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ecm1Q61508 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ecm1Q61508 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ecm1Q61508 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ecm1Q61508 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ecm1Q61508 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ecm1Q61508 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ecm1Q61508 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ecm1Q61508 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ecm1Q61508 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ecm1Q61508 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ecm1Q61508 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ecm1Q61508 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ecm1Q61508 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ecm1Q61508 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms