Protein–RNA interactions for Protein: Q61500

Itm2a, Integral membrane protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2aQ61500 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itm2aQ61500 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Itm2aQ61500 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Itm2aQ61500 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Itm2aQ61500 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Itm2aQ61500 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Itm2aQ61500 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Itm2aQ61500 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itm2aQ61500 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itm2aQ61500 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itm2aQ61500 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itm2aQ61500 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itm2aQ61500 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms