Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Neurod1Q60867 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Neurod1Q60867 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Neurod1Q60867 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Neurod1Q60867 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Neurod1Q60867 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Neurod1Q60867 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Neurod1Q60867 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Neurod1Q60867 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Neurod1Q60867 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Neurod1Q60867 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Neurod1Q60867 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Neurod1Q60867 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Neurod1Q60867 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Neurod1Q60867 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Neurod1Q60867 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Neurod1Q60867 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Neurod1Q60867 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Neurod1Q60867 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Neurod1Q60867 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Neurod1Q60867 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Neurod1Q60867 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Neurod1Q60867 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Neurod1Q60867 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Neurod1Q60867 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Neurod1Q60867 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Neurod1Q60867 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Neurod1Q60867 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Neurod1Q60867 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Neurod1Q60867 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Neurod1Q60867 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Neurod1Q60867 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Neurod1Q60867 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Neurod1Q60867 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Neurod1Q60867 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Neurod1Q60867 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Neurod1Q60867 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Neurod1Q60867 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Neurod1Q60867 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Neurod1Q60867 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Neurod1Q60867 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Neurod1Q60867 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Neurod1Q60867 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Neurod1Q60867 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Neurod1Q60867 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Neurod1Q60867 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Neurod1Q60867 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Neurod1Q60867 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Neurod1Q60867 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Neurod1Q60867 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Neurod1Q60867 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Neurod1Q60867 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Neurod1Q60867 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Neurod1Q60867 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Neurod1Q60867 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Neurod1Q60867 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Neurod1Q60867 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Neurod1Q60867 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Neurod1Q60867 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Neurod1Q60867 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Neurod1Q60867 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Neurod1Q60867 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Neurod1Q60867 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Neurod1Q60867 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Neurod1Q60867 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Neurod1Q60867 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Neurod1Q60867 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Neurod1Q60867 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Neurod1Q60867 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Neurod1Q60867 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Neurod1Q60867 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Neurod1Q60867 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Neurod1Q60867 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Neurod1Q60867 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Neurod1Q60867 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Neurod1Q60867 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Neurod1Q60867 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Neurod1Q60867 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Neurod1Q60867 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Neurod1Q60867 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Neurod1Q60867 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Neurod1Q60867 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Neurod1Q60867 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Neurod1Q60867 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Neurod1Q60867 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Neurod1Q60867 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Neurod1Q60867 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Neurod1Q60867 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Neurod1Q60867 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Neurod1Q60867 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Neurod1Q60867 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Neurod1Q60867 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Neurod1Q60867 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Neurod1Q60867 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Neurod1Q60867 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Neurod1Q60867 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Neurod1Q60867 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Neurod1Q60867 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Neurod1Q60867 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Neurod1Q60867 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms