Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klf4Q60793 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf4Q60793 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms