Protein–RNA interactions for Protein: Q60778

Nfkbib, NF-kappa-B inhibitor beta, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbibQ60778 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NfkbibQ60778 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NfkbibQ60778 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NfkbibQ60778 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NfkbibQ60778 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NfkbibQ60778 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NfkbibQ60778 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NfkbibQ60778 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NfkbibQ60778 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NfkbibQ60778 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NfkbibQ60778 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NfkbibQ60778 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NfkbibQ60778 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NfkbibQ60778 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NfkbibQ60778 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NfkbibQ60778 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NfkbibQ60778 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NfkbibQ60778 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NfkbibQ60778 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NfkbibQ60778 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NfkbibQ60778 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NfkbibQ60778 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NfkbibQ60778 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NfkbibQ60778 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NfkbibQ60778 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NfkbibQ60778 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NfkbibQ60778 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NfkbibQ60778 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NfkbibQ60778 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NfkbibQ60778 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NfkbibQ60778 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NfkbibQ60778 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NfkbibQ60778 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NfkbibQ60778 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NfkbibQ60778 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NfkbibQ60778 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NfkbibQ60778 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NfkbibQ60778 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NfkbibQ60778 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NfkbibQ60778 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NfkbibQ60778 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NfkbibQ60778 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NfkbibQ60778 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NfkbibQ60778 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NfkbibQ60778 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NfkbibQ60778 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NfkbibQ60778 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NfkbibQ60778 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NfkbibQ60778 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NfkbibQ60778 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NfkbibQ60778 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NfkbibQ60778 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NfkbibQ60778 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NfkbibQ60778 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NfkbibQ60778 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NfkbibQ60778 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NfkbibQ60778 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NfkbibQ60778 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NfkbibQ60778 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NfkbibQ60778 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NfkbibQ60778 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NfkbibQ60778 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NfkbibQ60778 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NfkbibQ60778 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NfkbibQ60778 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NfkbibQ60778 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NfkbibQ60778 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NfkbibQ60778 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NfkbibQ60778 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NfkbibQ60778 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NfkbibQ60778 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NfkbibQ60778 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NfkbibQ60778 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NfkbibQ60778 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NfkbibQ60778 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NfkbibQ60778 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NfkbibQ60778 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NfkbibQ60778 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NfkbibQ60778 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NfkbibQ60778 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NfkbibQ60778 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NfkbibQ60778 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NfkbibQ60778 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NfkbibQ60778 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NfkbibQ60778 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NfkbibQ60778 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NfkbibQ60778 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NfkbibQ60778 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms