Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp20Q5XG71 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Utp20Q5XG71 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms