Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Med13Q5SWW4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Med13Q5SWW4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Med13Q5SWW4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Med13Q5SWW4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Med13Q5SWW4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Med13Q5SWW4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Med13Q5SWW4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Med13Q5SWW4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Med13Q5SWW4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Med13Q5SWW4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Med13Q5SWW4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Med13Q5SWW4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Med13Q5SWW4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Med13Q5SWW4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Med13Q5SWW4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Med13Q5SWW4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Med13Q5SWW4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Med13Q5SWW4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Med13Q5SWW4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Med13Q5SWW4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Med13Q5SWW4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Med13Q5SWW4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Med13Q5SWW4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Med13Q5SWW4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Med13Q5SWW4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Med13Q5SWW4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Med13Q5SWW4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Med13Q5SWW4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Med13Q5SWW4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Med13Q5SWW4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Med13Q5SWW4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Med13Q5SWW4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Med13Q5SWW4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Med13Q5SWW4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Med13Q5SWW4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Med13Q5SWW4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Med13Q5SWW4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Med13Q5SWW4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Med13Q5SWW4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Med13Q5SWW4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Med13Q5SWW4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med13Q5SWW4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms