Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPW0

Vps54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps54Q5SPW0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps54Q5SPW0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Vps54Q5SPW0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps54Q5SPW0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vps54Q5SPW0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vps54Q5SPW0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps54Q5SPW0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps54Q5SPW0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps54Q5SPW0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps54Q5SPW0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps54Q5SPW0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps54Q5SPW0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps54Q5SPW0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps54Q5SPW0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps54Q5SPW0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps54Q5SPW0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms