Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlha9Q5RJB0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms