Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCJ1

Rapgef6, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef6Q5NCJ1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rapgef6Q5NCJ1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rapgef6Q5NCJ1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rapgef6Q5NCJ1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rapgef6Q5NCJ1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rapgef6Q5NCJ1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rapgef6Q5NCJ1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rapgef6Q5NCJ1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rapgef6Q5NCJ1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rapgef6Q5NCJ1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rapgef6Q5NCJ1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Rapgef6Q5NCJ1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rapgef6Q5NCJ1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rapgef6Q5NCJ1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rapgef6Q5NCJ1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rapgef6Q5NCJ1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rapgef6Q5NCJ1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rapgef6Q5NCJ1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rapgef6Q5NCJ1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rapgef6Q5NCJ1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rapgef6Q5NCJ1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rapgef6Q5NCJ1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rapgef6Q5NCJ1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Rapgef6Q5NCJ1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rapgef6Q5NCJ1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rapgef6Q5NCJ1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Rapgef6Q5NCJ1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rapgef6Q5NCJ1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rapgef6Q5NCJ1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rapgef6Q5NCJ1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rapgef6Q5NCJ1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rapgef6Q5NCJ1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rapgef6Q5NCJ1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Rapgef6Q5NCJ1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rapgef6Q5NCJ1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rapgef6Q5NCJ1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rapgef6Q5NCJ1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rapgef6Q5NCJ1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Rapgef6Q5NCJ1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Rapgef6Q5NCJ1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rapgef6Q5NCJ1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rapgef6Q5NCJ1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rapgef6Q5NCJ1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rapgef6Q5NCJ1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rapgef6Q5NCJ1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rapgef6Q5NCJ1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rapgef6Q5NCJ1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rapgef6Q5NCJ1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rapgef6Q5NCJ1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rapgef6Q5NCJ1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rapgef6Q5NCJ1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rapgef6Q5NCJ1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rapgef6Q5NCJ1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rapgef6Q5NCJ1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Rapgef6Q5NCJ1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rapgef6Q5NCJ1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Rapgef6Q5NCJ1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rapgef6Q5NCJ1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rapgef6Q5NCJ1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rapgef6Q5NCJ1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rapgef6Q5NCJ1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rapgef6Q5NCJ1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rapgef6Q5NCJ1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rapgef6Q5NCJ1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rapgef6Q5NCJ1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rapgef6Q5NCJ1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rapgef6Q5NCJ1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Rapgef6Q5NCJ1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rapgef6Q5NCJ1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rapgef6Q5NCJ1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rapgef6Q5NCJ1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rapgef6Q5NCJ1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rapgef6Q5NCJ1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rapgef6Q5NCJ1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rapgef6Q5NCJ1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rapgef6Q5NCJ1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rapgef6Q5NCJ1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rapgef6Q5NCJ1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rapgef6Q5NCJ1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Rapgef6Q5NCJ1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rapgef6Q5NCJ1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rapgef6Q5NCJ1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rapgef6Q5NCJ1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rapgef6Q5NCJ1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rapgef6Q5NCJ1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Rapgef6Q5NCJ1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Rapgef6Q5NCJ1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rapgef6Q5NCJ1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rapgef6Q5NCJ1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rapgef6Q5NCJ1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rapgef6Q5NCJ1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rapgef6Q5NCJ1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rapgef6Q5NCJ1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rapgef6Q5NCJ1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rapgef6Q5NCJ1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rapgef6Q5NCJ1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rapgef6Q5NCJ1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rapgef6Q5NCJ1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rapgef6Q5NCJ1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms