Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpm3Q5F4S9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpm3Q5F4S9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpm3Q5F4S9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpm3Q5F4S9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpm3Q5F4S9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpm3Q5F4S9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpm3Q5F4S9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpm3Q5F4S9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpm3Q5F4S9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpm3Q5F4S9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpm3Q5F4S9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpm3Q5F4S9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpm3Q5F4S9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpm3Q5F4S9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpm3Q5F4S9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpm3Q5F4S9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpm3Q5F4S9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trpm3Q5F4S9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trpm3Q5F4S9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trpm3Q5F4S9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trpm3Q5F4S9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trpm3Q5F4S9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trpm3Q5F4S9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trpm3Q5F4S9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpm3Q5F4S9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpm3Q5F4S9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpm3Q5F4S9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpm3Q5F4S9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpm3Q5F4S9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpm3Q5F4S9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpm3Q5F4S9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpm3Q5F4S9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trpm3Q5F4S9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trpm3Q5F4S9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trpm3Q5F4S9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trpm3Q5F4S9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trpm3Q5F4S9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trpm3Q5F4S9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trpm3Q5F4S9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trpm3Q5F4S9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpm3Q5F4S9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpm3Q5F4S9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpm3Q5F4S9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpm3Q5F4S9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpm3Q5F4S9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpm3Q5F4S9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpm3Q5F4S9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpm3Q5F4S9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpm3Q5F4S9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpm3Q5F4S9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpm3Q5F4S9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Trpm3Q5F4S9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trpm3Q5F4S9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trpm3Q5F4S9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trpm3Q5F4S9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trpm3Q5F4S9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trpm3Q5F4S9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trpm3Q5F4S9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpm3Q5F4S9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpm3Q5F4S9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpm3Q5F4S9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpm3Q5F4S9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpm3Q5F4S9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpm3Q5F4S9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpm3Q5F4S9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpm3Q5F4S9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpm3Q5F4S9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpm3Q5F4S9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpm3Q5F4S9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpm3Q5F4S9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpm3Q5F4S9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpm3Q5F4S9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpm3Q5F4S9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpm3Q5F4S9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpm3Q5F4S9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpm3Q5F4S9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpm3Q5F4S9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpm3Q5F4S9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpm3Q5F4S9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpm3Q5F4S9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpm3Q5F4S9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpm3Q5F4S9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpm3Q5F4S9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpm3Q5F4S9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpm3Q5F4S9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpm3Q5F4S9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpm3Q5F4S9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpm3Q5F4S9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpm3Q5F4S9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpm3Q5F4S9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpm3Q5F4S9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpm3Q5F4S9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpm3Q5F4S9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpm3Q5F4S9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpm3Q5F4S9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpm3Q5F4S9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpm3Q5F4S9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Trpm3Q5F4S9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trpm3Q5F4S9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms