Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZGD8

Nxf2, Nuclear RNA export factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxf2Q4ZGD8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nxf2Q4ZGD8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nxf2Q4ZGD8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nxf2Q4ZGD8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nxf2Q4ZGD8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nxf2Q4ZGD8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nxf2Q4ZGD8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nxf2Q4ZGD8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nxf2Q4ZGD8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nxf2Q4ZGD8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Nxf2Q4ZGD8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nxf2Q4ZGD8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nxf2Q4ZGD8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nxf2Q4ZGD8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nxf2Q4ZGD8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nxf2Q4ZGD8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nxf2Q4ZGD8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nxf2Q4ZGD8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nxf2Q4ZGD8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nxf2Q4ZGD8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nxf2Q4ZGD8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nxf2Q4ZGD8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nxf2Q4ZGD8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nxf2Q4ZGD8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nxf2Q4ZGD8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nxf2Q4ZGD8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nxf2Q4ZGD8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nxf2Q4ZGD8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nxf2Q4ZGD8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nxf2Q4ZGD8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nxf2Q4ZGD8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nxf2Q4ZGD8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nxf2Q4ZGD8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nxf2Q4ZGD8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nxf2Q4ZGD8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nxf2Q4ZGD8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nxf2Q4ZGD8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nxf2Q4ZGD8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nxf2Q4ZGD8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nxf2Q4ZGD8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Nxf2Q4ZGD8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nxf2Q4ZGD8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nxf2Q4ZGD8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nxf2Q4ZGD8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nxf2Q4ZGD8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nxf2Q4ZGD8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nxf2Q4ZGD8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nxf2Q4ZGD8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Nxf2Q4ZGD8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nxf2Q4ZGD8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nxf2Q4ZGD8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nxf2Q4ZGD8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nxf2Q4ZGD8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nxf2Q4ZGD8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nxf2Q4ZGD8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Nxf2Q4ZGD8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nxf2Q4ZGD8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nxf2Q4ZGD8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nxf2Q4ZGD8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nxf2Q4ZGD8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nxf2Q4ZGD8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nxf2Q4ZGD8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nxf2Q4ZGD8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nxf2Q4ZGD8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nxf2Q4ZGD8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nxf2Q4ZGD8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nxf2Q4ZGD8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nxf2Q4ZGD8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nxf2Q4ZGD8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nxf2Q4ZGD8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nxf2Q4ZGD8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Nxf2Q4ZGD8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nxf2Q4ZGD8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nxf2Q4ZGD8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nxf2Q4ZGD8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nxf2Q4ZGD8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nxf2Q4ZGD8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nxf2Q4ZGD8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nxf2Q4ZGD8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nxf2Q4ZGD8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nxf2Q4ZGD8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nxf2Q4ZGD8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nxf2Q4ZGD8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nxf2Q4ZGD8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nxf2Q4ZGD8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nxf2Q4ZGD8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nxf2Q4ZGD8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nxf2Q4ZGD8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nxf2Q4ZGD8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nxf2Q4ZGD8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nxf2Q4ZGD8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nxf2Q4ZGD8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nxf2Q4ZGD8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nxf2Q4ZGD8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nxf2Q4ZGD8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nxf2Q4ZGD8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nxf2Q4ZGD8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nxf2Q4ZGD8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nxf2Q4ZGD8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nxf2Q4ZGD8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms