Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc3lQ4KL14 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc3lQ4KL14 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc3lQ4KL14 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc3lQ4KL14 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc3lQ4KL14 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc3lQ4KL14 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc3lQ4KL14 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc3lQ4KL14 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc3lQ4KL14 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc3lQ4KL14 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc3lQ4KL14 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc3lQ4KL14 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc3lQ4KL14 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc3lQ4KL14 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trappc3lQ4KL14 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc3lQ4KL14 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc3lQ4KL14 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc3lQ4KL14 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc3lQ4KL14 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc3lQ4KL14 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms