Protein–RNA interactions for Protein: Q499E0

Brinp3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brinp3Q499E0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Brinp3Q499E0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Brinp3Q499E0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Brinp3Q499E0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Brinp3Q499E0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Brinp3Q499E0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Brinp3Q499E0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Brinp3Q499E0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Brinp3Q499E0 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Brinp3Q499E0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Brinp3Q499E0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Brinp3Q499E0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Brinp3Q499E0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Brinp3Q499E0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Brinp3Q499E0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Brinp3Q499E0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Brinp3Q499E0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Brinp3Q499E0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Brinp3Q499E0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Brinp3Q499E0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Brinp3Q499E0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Brinp3Q499E0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Brinp3Q499E0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Brinp3Q499E0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Brinp3Q499E0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Brinp3Q499E0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Brinp3Q499E0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Brinp3Q499E0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Brinp3Q499E0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Brinp3Q499E0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Brinp3Q499E0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Brinp3Q499E0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Brinp3Q499E0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Brinp3Q499E0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Brinp3Q499E0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Brinp3Q499E0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Brinp3Q499E0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Brinp3Q499E0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Brinp3Q499E0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Brinp3Q499E0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Brinp3Q499E0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Brinp3Q499E0 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Brinp3Q499E0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Brinp3Q499E0 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Brinp3Q499E0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Brinp3Q499E0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Brinp3Q499E0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Brinp3Q499E0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Brinp3Q499E0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Brinp3Q499E0 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Brinp3Q499E0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Brinp3Q499E0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Brinp3Q499E0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Brinp3Q499E0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Brinp3Q499E0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Brinp3Q499E0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Brinp3Q499E0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Brinp3Q499E0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Brinp3Q499E0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Brinp3Q499E0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Brinp3Q499E0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Brinp3Q499E0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Brinp3Q499E0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Brinp3Q499E0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Brinp3Q499E0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Brinp3Q499E0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Brinp3Q499E0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Brinp3Q499E0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Brinp3Q499E0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Brinp3Q499E0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Brinp3Q499E0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Brinp3Q499E0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Brinp3Q499E0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Brinp3Q499E0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Brinp3Q499E0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Brinp3Q499E0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Brinp3Q499E0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Brinp3Q499E0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Brinp3Q499E0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Brinp3Q499E0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Brinp3Q499E0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Brinp3Q499E0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Brinp3Q499E0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Brinp3Q499E0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Brinp3Q499E0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Brinp3Q499E0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Brinp3Q499E0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Brinp3Q499E0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Brinp3Q499E0 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Brinp3Q499E0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Brinp3Q499E0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Brinp3Q499E0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Brinp3Q499E0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Brinp3Q499E0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Brinp3Q499E0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Brinp3Q499E0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Brinp3Q499E0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Brinp3Q499E0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Brinp3Q499E0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Brinp3Q499E0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms