Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2C1

Krtap9-3, Keratin-associated protein 9-3, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap9-3Q3V2C1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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Krtap9-3Q3V2C1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Krtap9-3Q3V2C1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms