Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ulk4Q3V129 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ulk4Q3V129 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ulk4Q3V129 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ulk4Q3V129 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ulk4Q3V129 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ulk4Q3V129 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ulk4Q3V129 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ulk4Q3V129 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ulk4Q3V129 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ulk4Q3V129 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ulk4Q3V129 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ulk4Q3V129 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ulk4Q3V129 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ulk4Q3V129 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ulk4Q3V129 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ulk4Q3V129 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ulk4Q3V129 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ulk4Q3V129 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ulk4Q3V129 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ulk4Q3V129 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ulk4Q3V129 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ulk4Q3V129 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ulk4Q3V129 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ulk4Q3V129 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ulk4Q3V129 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ulk4Q3V129 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ulk4Q3V129 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ulk4Q3V129 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ulk4Q3V129 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ulk4Q3V129 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ulk4Q3V129 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ulk4Q3V129 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ulk4Q3V129 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ulk4Q3V129 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ulk4Q3V129 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ulk4Q3V129 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ulk4Q3V129 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ulk4Q3V129 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ulk4Q3V129 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ulk4Q3V129 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ulk4Q3V129 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ulk4Q3V129 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ulk4Q3V129 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ulk4Q3V129 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ulk4Q3V129 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ulk4Q3V129 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ulk4Q3V129 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ulk4Q3V129 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ulk4Q3V129 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ulk4Q3V129 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ulk4Q3V129 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ulk4Q3V129 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ulk4Q3V129 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ulk4Q3V129 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ulk4Q3V129 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ulk4Q3V129 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ulk4Q3V129 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ulk4Q3V129 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ulk4Q3V129 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ulk4Q3V129 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ulk4Q3V129 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ulk4Q3V129 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ulk4Q3V129 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ulk4Q3V129 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ulk4Q3V129 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ulk4Q3V129 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ulk4Q3V129 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ulk4Q3V129 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ulk4Q3V129 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ulk4Q3V129 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ulk4Q3V129 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ulk4Q3V129 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ulk4Q3V129 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ulk4Q3V129 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ulk4Q3V129 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ulk4Q3V129 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ulk4Q3V129 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ulk4Q3V129 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ulk4Q3V129 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ulk4Q3V129 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ulk4Q3V129 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms