Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K5

4930567H17Rik, RIKEN cDNA 4930567H17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930567H17RikQ3V0K5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
4930567H17RikQ3V0K5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms