Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW31

Pate2, Prostate and testis expressed protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate2Q3UW31 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pate2Q3UW31 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pate2Q3UW31 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms