Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Skap1Q3UUV5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms