Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU96

Cdc42bpa, Serine/threonine-protein kinase MRCK alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpaQ3UU96 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cdc42bpaQ3UU96 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cdc42bpaQ3UU96 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cdc42bpaQ3UU96 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cdc42bpaQ3UU96 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cdc42bpaQ3UU96 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cdc42bpaQ3UU96 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Cdc42bpaQ3UU96 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cdc42bpaQ3UU96 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Cdc42bpaQ3UU96 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cdc42bpaQ3UU96 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cdc42bpaQ3UU96 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cdc42bpaQ3UU96 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cdc42bpaQ3UU96 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cdc42bpaQ3UU96 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cdc42bpaQ3UU96 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cdc42bpaQ3UU96 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Cdc42bpaQ3UU96 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cdc42bpaQ3UU96 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
Cdc42bpaQ3UU96 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Cdc42bpaQ3UU96 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Cdc42bpaQ3UU96 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cdc42bpaQ3UU96 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Cdc42bpaQ3UU96 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cdc42bpaQ3UU96 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Cdc42bpaQ3UU96 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cdc42bpaQ3UU96 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cdc42bpaQ3UU96 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cdc42bpaQ3UU96 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cdc42bpaQ3UU96 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cdc42bpaQ3UU96 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cdc42bpaQ3UU96 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cdc42bpaQ3UU96 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cdc42bpaQ3UU96 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Cdc42bpaQ3UU96 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cdc42bpaQ3UU96 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Cdc42bpaQ3UU96 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cdc42bpaQ3UU96 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Cdc42bpaQ3UU96 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cdc42bpaQ3UU96 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cdc42bpaQ3UU96 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cdc42bpaQ3UU96 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cdc42bpaQ3UU96 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Cdc42bpaQ3UU96 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cdc42bpaQ3UU96 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Cdc42bpaQ3UU96 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cdc42bpaQ3UU96 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Cdc42bpaQ3UU96 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cdc42bpaQ3UU96 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cdc42bpaQ3UU96 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Cdc42bpaQ3UU96 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Cdc42bpaQ3UU96 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cdc42bpaQ3UU96 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cdc42bpaQ3UU96 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Cdc42bpaQ3UU96 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Cdc42bpaQ3UU96 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
Cdc42bpaQ3UU96 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cdc42bpaQ3UU96 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Cdc42bpaQ3UU96 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Cdc42bpaQ3UU96 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cdc42bpaQ3UU96 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cdc42bpaQ3UU96 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cdc42bpaQ3UU96 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cdc42bpaQ3UU96 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cdc42bpaQ3UU96 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdc42bpaQ3UU96 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdc42bpaQ3UU96 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdc42bpaQ3UU96 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdc42bpaQ3UU96 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdc42bpaQ3UU96 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdc42bpaQ3UU96 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdc42bpaQ3UU96 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdc42bpaQ3UU96 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdc42bpaQ3UU96 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdc42bpaQ3UU96 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdc42bpaQ3UU96 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdc42bpaQ3UU96 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdc42bpaQ3UU96 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdc42bpaQ3UU96 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdc42bpaQ3UU96 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdc42bpaQ3UU96 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdc42bpaQ3UU96 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdc42bpaQ3UU96 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdc42bpaQ3UU96 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdc42bpaQ3UU96 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdc42bpaQ3UU96 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cdc42bpaQ3UU96 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cdc42bpaQ3UU96 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cdc42bpaQ3UU96 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cdc42bpaQ3UU96 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cdc42bpaQ3UU96 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cdc42bpaQ3UU96 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cdc42bpaQ3UU96 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cdc42bpaQ3UU96 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cdc42bpaQ3UU96 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdc42bpaQ3UU96 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdc42bpaQ3UU96 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdc42bpaQ3UU96 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdc42bpaQ3UU96 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdc42bpaQ3UU96 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms