Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Skap2Q3UND0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms