Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp19Q3UJD6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp19Q3UJD6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp19Q3UJD6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp19Q3UJD6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp19Q3UJD6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Usp19Q3UJD6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp19Q3UJD6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp19Q3UJD6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Usp19Q3UJD6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp19Q3UJD6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp19Q3UJD6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp19Q3UJD6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp19Q3UJD6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp19Q3UJD6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp19Q3UJD6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp19Q3UJD6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp19Q3UJD6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp19Q3UJD6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp19Q3UJD6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp19Q3UJD6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp19Q3UJD6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp19Q3UJD6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp19Q3UJD6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp19Q3UJD6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp19Q3UJD6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp19Q3UJD6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp19Q3UJD6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp19Q3UJD6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp19Q3UJD6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp19Q3UJD6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp19Q3UJD6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp19Q3UJD6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp19Q3UJD6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp19Q3UJD6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp19Q3UJD6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp19Q3UJD6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp19Q3UJD6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp19Q3UJD6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp19Q3UJD6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp19Q3UJD6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp19Q3UJD6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp19Q3UJD6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp19Q3UJD6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp19Q3UJD6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp19Q3UJD6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp19Q3UJD6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp19Q3UJD6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp19Q3UJD6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp19Q3UJD6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp19Q3UJD6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp19Q3UJD6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp19Q3UJD6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp19Q3UJD6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp19Q3UJD6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp19Q3UJD6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Usp19Q3UJD6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Usp19Q3UJD6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp19Q3UJD6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp19Q3UJD6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp19Q3UJD6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp19Q3UJD6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp19Q3UJD6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp19Q3UJD6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp19Q3UJD6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp19Q3UJD6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp19Q3UJD6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp19Q3UJD6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp19Q3UJD6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp19Q3UJD6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp19Q3UJD6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp19Q3UJD6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp19Q3UJD6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp19Q3UJD6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp19Q3UJD6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp19Q3UJD6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp19Q3UJD6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp19Q3UJD6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp19Q3UJD6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp19Q3UJD6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp19Q3UJD6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp19Q3UJD6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp19Q3UJD6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp19Q3UJD6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp19Q3UJD6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp19Q3UJD6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp19Q3UJD6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp19Q3UJD6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp19Q3UJD6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp19Q3UJD6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp19Q3UJD6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp19Q3UJD6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp19Q3UJD6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp19Q3UJD6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp19Q3UJD6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp19Q3UJD6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp19Q3UJD6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp19Q3UJD6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp19Q3UJD6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp19Q3UJD6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms