Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc34Q3UI66 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc34Q3UI66 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms