Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Puf60Q3UEB3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Puf60Q3UEB3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Puf60Q3UEB3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Puf60Q3UEB3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Puf60Q3UEB3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Puf60Q3UEB3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Puf60Q3UEB3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Puf60Q3UEB3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Puf60Q3UEB3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Puf60Q3UEB3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Puf60Q3UEB3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Puf60Q3UEB3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Puf60Q3UEB3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Puf60Q3UEB3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Puf60Q3UEB3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Puf60Q3UEB3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Puf60Q3UEB3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Puf60Q3UEB3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Puf60Q3UEB3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Puf60Q3UEB3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Puf60Q3UEB3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Puf60Q3UEB3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Puf60Q3UEB3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Puf60Q3UEB3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Puf60Q3UEB3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Puf60Q3UEB3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Puf60Q3UEB3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Puf60Q3UEB3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Puf60Q3UEB3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Puf60Q3UEB3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Puf60Q3UEB3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Puf60Q3UEB3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Puf60Q3UEB3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Puf60Q3UEB3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Puf60Q3UEB3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Puf60Q3UEB3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Puf60Q3UEB3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Puf60Q3UEB3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Puf60Q3UEB3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Puf60Q3UEB3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Puf60Q3UEB3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Puf60Q3UEB3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Puf60Q3UEB3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Puf60Q3UEB3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Puf60Q3UEB3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Puf60Q3UEB3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Puf60Q3UEB3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Puf60Q3UEB3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Puf60Q3UEB3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Puf60Q3UEB3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Puf60Q3UEB3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Puf60Q3UEB3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Puf60Q3UEB3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Puf60Q3UEB3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Puf60Q3UEB3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Puf60Q3UEB3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Puf60Q3UEB3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Puf60Q3UEB3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Puf60Q3UEB3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Puf60Q3UEB3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Puf60Q3UEB3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Puf60Q3UEB3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Puf60Q3UEB3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Puf60Q3UEB3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Puf60Q3UEB3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Puf60Q3UEB3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Puf60Q3UEB3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Puf60Q3UEB3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Puf60Q3UEB3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Puf60Q3UEB3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Puf60Q3UEB3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Puf60Q3UEB3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Puf60Q3UEB3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Puf60Q3UEB3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Puf60Q3UEB3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Puf60Q3UEB3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Puf60Q3UEB3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Puf60Q3UEB3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Puf60Q3UEB3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Puf60Q3UEB3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Puf60Q3UEB3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Puf60Q3UEB3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Puf60Q3UEB3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Puf60Q3UEB3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Puf60Q3UEB3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Puf60Q3UEB3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Puf60Q3UEB3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Puf60Q3UEB3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Puf60Q3UEB3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Puf60Q3UEB3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Puf60Q3UEB3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Puf60Q3UEB3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Puf60Q3UEB3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Puf60Q3UEB3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Puf60Q3UEB3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Puf60Q3UEB3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Puf60Q3UEB3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Puf60Q3UEB3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Puf60Q3UEB3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms