Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDE2

Ttll12, Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll12Q3UDE2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttll12Q3UDE2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttll12Q3UDE2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttll12Q3UDE2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttll12Q3UDE2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttll12Q3UDE2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttll12Q3UDE2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ttll12Q3UDE2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ttll12Q3UDE2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms