Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kdm4dQ3U2K5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms